我校亞熱帶生物多樣性實(shí)驗(yàn)室寇一翾博士與美國(guó)加州大學(xué)歐文分校的科學(xué)家合作，在水稻群體進(jìn)化基因組學(xué)研究方面取得新進(jìn)展，研究成果以“亞洲稻馴化中結(jié)構(gòu)變異的演化基因組研究（Evolutionary Genomics of Structural Variation in Asian Rice (Oryza sativa) Domestication）”為題，于2020年7月18日在《分子生物與進(jìn)化》（Molecular Biology and Evolution）上在線發(fā)表?？芤宦Q博士為該文第一作者。
結(jié)構(gòu)變異作為基因組變異的重要組成部分，對(duì)植物表型變異產(chǎn)生了巨大的影響，并在生產(chǎn)實(shí)踐中得到了廣泛的應(yīng)用，然而從群體基因組水平上深度揭示其變化規(guī)律的研究甚少。該文以亞洲栽培稻Oryza sativa與其野生祖先種O. rufipogon為研究對(duì)象，基于基因組重測(cè)序數(shù)據(jù)（347份材料），以及三代和組裝基因組數(shù)據(jù)，鑒定了水稻群體基因組水平上的結(jié)構(gòu)變異，包括倒位、重復(fù)、刪除、易位，以及轉(zhuǎn)座元件；通過位點(diǎn)頻譜變化規(guī)律和遺傳負(fù)荷分析，揭示結(jié)構(gòu)變異作用于水稻的馴化成本（domestication cost），并主要以有害突變的形式存在，尤其是倒位和轉(zhuǎn)座元件SINE和mariner家族；此外，通過比較基因組分析發(fā)現(xiàn)，在水稻馴化過程中通過結(jié)構(gòu)變異獲得和丟失數(shù)百個(gè)基因，在一些顯著分化的結(jié)構(gòu)變異中還富集了一批與重要的農(nóng)藝性狀相關(guān)的基因。該研究不僅對(duì)水稻遺傳育種具有重要的指導(dǎo)意義，同時(shí)也為植物馴化相關(guān)的研究，以及植物群體進(jìn)化基因組學(xué)研究提供新的研究思路。
我校亞熱帶生物多樣性實(shí)驗(yàn)室自2007年成立以來(lái)，先后承擔(dān)科研項(xiàng)目20余項(xiàng)，其中國(guó)家自然科學(xué)基金15項(xiàng)，在Molecular Biology and Evolution等國(guó)際著名學(xué)術(shù)刊物上發(fā)表相關(guān)研究成果近30篇，獲2019年度江西省自然科學(xué)一等獎(jiǎng)，為我校植物學(xué)、生態(tài)學(xué)和林學(xué)等學(xué)科發(fā)展提供了支撐。
文章鏈接：https://academic.oup.com/mbe/advance-article/doi/10.1093/molbev/msaa185/5873527?searchresult=1
供稿：農(nóng)學(xué)院 審核：科技處
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