日前，我校豬遺傳改良與養(yǎng)殖技術(shù)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室黃路生院士團(tuán)隊(duì)與加州大學(xué)伯克利分校等單位合作在《Molecular Biology and Evolution》（IF=16.24）發(fā)表題為“Human-mediated admixture and selection shape the diversity on the modern swine (Sus scrofa) Y chromosomes”的研究論文，系統(tǒng)闡述了人類介導(dǎo)的滲入和選擇塑造現(xiàn)代家豬Y染色體的多樣性以及從父系遺傳角度揭示豬的演化歷史。黃路生院士、學(xué)校首席教授艾華水研究員和加州大學(xué)伯克利分校Rasmus Nielsen教授作為共同通訊作者、2017級(jí)博士研究生張明鵬為共同第一作者，江西農(nóng)業(yè)大學(xué)作為第一通訊作者單位。
豬（Sus scrofa）是給人類提供動(dòng)物蛋白的最重要來源之一，也是人類疾病研究的重要生物醫(yī)學(xué)模型之一。由于豬在經(jīng)濟(jì)和科學(xué)研究上的重要性，人們對(duì)現(xiàn)代家豬的起源、進(jìn)化、馴化和選擇等重要基礎(chǔ)科學(xué)問題非常關(guān)注。Y染色體多樣性的維持及其進(jìn)化是全球研究的熱點(diǎn)，這一方面是因?yàn)?/span>Y染色體是父系單拷貝遺傳且缺乏重組，同時(shí)更重要的是Y染色體不斷在丟失基因并具有逐漸縮短的趨勢(shì)。
黃路生院士團(tuán)隊(duì)對(duì)來自9個(gè)亞歐品種的80頭代表性家豬個(gè)體進(jìn)行了高深度重測(cè)序。結(jié)合團(tuán)隊(duì)之前發(fā)表的測(cè)序數(shù)據(jù)及公共可用數(shù)據(jù)，總共獲取了一個(gè)包括27個(gè)品種205個(gè)個(gè)體的高質(zhì)量數(shù)據(jù)集。在其中103頭公豬中共鑒定出了42,288個(gè)可靠的Y染色體單核苷酸多態(tài)位點(diǎn)（SNPs），其中96.1%是新檢測(cè)到的。這些高質(zhì)量SNPs成為從Y染色體遺傳的角度重新闡明豬進(jìn)化歷史的基礎(chǔ)。
黃路生院士及其團(tuán)隊(duì)在研究的亞歐豬群體中發(fā)現(xiàn)了兩個(gè)高度分化的Y染色體單倍型群：一個(gè)只存在于亞洲豬群中，另一個(gè)則存在于全部歐洲豬群中和部分亞洲豬群中。他們還發(fā)現(xiàn)了過去200年間家豬從歐洲到亞洲的三次獨(dú)立滲透事件的群體遺傳學(xué)證據(jù)，并與歷史記載相互印證。此外，相對(duì)于常染色體，歐洲血統(tǒng)的Y染色體在部分中國豬種中處于一種過量富集狀態(tài)，這一結(jié)果不能僅用性別偏倚滲入和遺傳漂移來解釋?；趫F(tuán)隊(duì)花費(fèi)12年時(shí)間構(gòu)建的嵌合家系群體，黃路生院士團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)歐洲Y單倍型與脂肪沉積性狀存在顯著負(fù)相關(guān)，基于上述結(jié)果，團(tuán)隊(duì)假設(shè)：中國豬群中歐洲Y染色體頻率的增加是由人工選擇造成的。另外，研究團(tuán)隊(duì)還檢測(cè)到了蘇門答臘野豬和亞洲野豬之間的Y染色體基因交流的證據(jù)。
上述新發(fā)現(xiàn)從父系遺傳的角度完善了豬的群體演化歷史，尤其是對(duì)現(xiàn)代家豬Y染色體的多樣性研究具有重要意義。
https://academic.oup.com/mbe/advance-article/doi/10.1093/molbev/msab230/6337983
供稿：科技處 程建華 審核：游金明
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